|
矮格拉/徐稻10号DH群体的SNP标记图谱构建及耐盐QTL定位分析
刘艳, 李景芳, 迟铭, 章雨沁, 孙志广, 李健, 杨波, 徐波, 邢运高, 周群, 王德荣, 陈庭木, 刘金波, 卢百关, 徐大勇, 王宝祥
2026, 40(3):
351-359.
DOI: 10.16819/j.1001-7216.2026.250604
【目的】土壤盐碱化是一个影响我国农业生产的重要非生物胁迫因素,挖掘水稻耐盐相关性状基因/QTL对保障盐碱地水稻的安全生产至关重要。【方法】以耐盐性差异较大的矮格拉和徐稻10号为亲本构建定位群体,利用田间和室内水培进行耐盐性鉴定,利用水稻1 K mGPS SNP芯片对定位群体进行基因分型,结合表型数据和基因型数据,利用QTL IciMapping 4.2软件进行QTL定位。【结果】通过QTL定位分析,最终鉴定出22个耐盐相关QTL,其中单株产量QTL 10个,每穗粒数QTL 4个,根长QTL 2个,根干质量QTL 6个,这些QTL位于水稻1、6、8、10、11和12号染色体上,LOD值为4.04~9.65,表型贡献率为3.37%~15.52%。根据新发现QTL(qST11)定位区间内的基因注释、与拟南芥的同源基因比对、时空表达分析和序列分析,最终筛选到1个编码羟基类固醇脱氢酶的候选基因LOC_Os11g30560 (OsHSD1)。【结论】在本研究检测到的22个QTL中,11个为已知耐盐性基因位点,11个是新鉴定位点。同时,本研究对新鉴定耐盐QTL(qST11)进行了候选基因分析,为进一步开展耐盐基因的克隆和遗传调控的解析奠定了基础。
|