中国水稻科学
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中国水稻科学  2011, Vol. 25 Issue (4): 365-369    DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2011.04.004
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利用重测序的染色体片段代换系群体定位水稻粒型QTL
徐建军1, 2, 赵强3, 汤在祥1, 赵元凤1, 朱磊1, 徐辰武1, 顾铭洪1, 韩斌3
1扬州大学 教育部植物功能基因组学重点实验室/江苏省作物遗传生理国家重点实验室, 江苏 扬州 225009; 2上海市松江区农业技术推广中心, 上海 201613; 3中国科学院  植物生理生态研究所, 上海 200233
Mapping of QTLs for Grain Shape Using WholeGenome Resequenced  Chromosome Segment Substitution Lines in Rice
XU  Jian-Jun1, 2 , ZHAO  Qiang3, TANG  Zai-Xiang1, ZHAO  Yuan-Feng1, ZHU  Lei1, XU  Chen-Wu1, GU  Ming-Hong1, HAN  Bin3
1Jiangsu Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology /Key Laboratory of Plant Function Genomics, Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China; 2Songjiang Agricultural Technology and Popularization Center of Shanghai, Shanghai 201613, China; 3Institute of Plant Physiology and Ecology, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200233, China
 全文: PDF (541 KB)   HTML (1 KB)   输出: BibTeX | EndNote (RIS)      背景资料
摘要 以一套用籼稻品种9311为受体、粳稻品种日本晴为供体构建的128个染色体片段代换系为材料,按随机区组实验设计种植,于成熟后考查代换系粒长、粒宽性状,利用多元回归分析方法,结合Bin图谱,鉴定出6个与粒长相关的QTL、2个与粒宽相关的QTL。其中,qGL3.1被定位在水稻第3染色体的5 792 954 bp区间内;qGL3.2被定位在第3染色体的917 878 bp区间内;qGL8.1被定位在第8染色体的889 543 bp区间内;qGL8.2被定位在第8染色体的208 614 bp区间内;qGL9.1被定位在第9染色体的1 149 685 bp区间内;qGL11.1被定位在第11染色体的3 184 760 bp区间内;qGW1.1被定位在第1染色体的200 070 bp区间内;qGW5.1被定位在第5染色体的704 905 bp区间内。上述QTL的准确定位,为进一步精细定位及克隆相应QTL和开展水稻粒型分子育种奠定了基础。
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徐建军1
2
赵强3
汤在祥1
赵元凤1
朱磊1
徐辰武1
顾铭洪1
韩斌3
关键词水稻   粒型   染色体片段代换系   数量性状基因座     
Abstract: One hundred and twentyeight chromosome segment substitution lines derived from 9311 as recipient and Nipponbare as donor, were used for mapping QTLs for grain shape by combining  the sequencingbased Binmap with a multiple linear regression analysis. Six  and  two   QTLs were identified for grian length(GL)  and grian width(GW), respectively. qGL3.1  was mapped in a region of 5 792 954 bp on chromosome 3, qGL3.2    in a region of 917 878 bp on chromosome 3; qGL81   in a region of 889 543 bp on chromosome 8;  qGL8.2   in a region of 208 614 bp on chromosome 8; qGL9.1   in a region of 1 149 685 bp on chromosome 9;  qGL11.1  in a region of 3 184 760 bp on chromosome 11; qGW1.1  in a region of 200 070 bp on chromosome 1;  and qGW5.1    in a region of 704 905 bp on chromosome 5. The results  provided a foundation for fine mapping QTLs and subsequent gene cloning.
Key words rice   grain shape   chromosome segment substitution lines   quantitative trait locus   
收稿日期: 2010-10-29;
基金资助:

国家973计划资助项目(2005CB120807)

引用本文:   
徐建军1,2,赵强3等. 利用重测序的染色体片段代换系群体定位水稻粒型QTL[J]. 中国水稻科学, 2011, 25(4): 365-369.
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