利用InDel和SSILP标记分析北方粳型超级稻的遗传组成

刘丹# ,王嘉宇# ,孙健,唐亮,陈温福*

doi:10.3969/j.issn.1001-7216.2014.02.006

中国水稻科学 >

2014 , Vol. 28 >Issue 2: 148 - 154

DOI: https://doi.org/10.3969/j.issn.1001-7216.2014.02.006

研究报告

利用InDel和SSILP标记分析北方粳型超级稻的遗传组成

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沈阳农业大学水稻研究所/农业部东北水稻生物学与遗传育种重点实验室/北方超级粳稻育种教育部重点实验室, 沈阳 110866;

收稿日期: 2013-05-06

修回日期: 2013-06-07

网络出版日期: 2014-03-10

基金资助

现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目（CARS0113）；辽宁省科技攻关重大项目（2012201002）；国家科技支撑计划资助项目（2011BAD35B0201， 2011BAD16B14）。

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Genetic Components Analysis on Super japonica Rice Using InDel and SSILP Molecular Markers

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Rice Research Institute, Shenyang Agricultural University /Key Laboratory of Northeast Rice Biology, Genetics and Breeding of Ministry of Agriculture/Key Laboratory of Northern japonica Super Rice Breeding, Ministry of Education, Shenyang 110161, China;

Received date: 2013-05-06

Revised date: 2013-06-07

Online published: 2014-03-10

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摘要

为明确籼稻血缘对北方粳型超级稻育种的贡献，利用89对籼粳特异性引物（34对InDel和55对SSILP）对15份粳型超级稻品种以及与其系谱密切相关的21份材料（12份1977-1999年育成的常规粳稻品种和9份1963-2000年育成的日本品种）的遗传组成进行分析。结果表明，15份粳型超级稻品种均含有一定的籼型血缘，且不同地区超级稻品种所含籼型基因频率（Fi）有所不同；对不同年代育成的参试材料的Fi进行比较分析，发现超级稻品种籼型基因型频率最高，Fi为0.068；12份常规粳稻品种次之，Fi为0.033；9份日本品种几乎不含有籼型血缘，Fi为0.011；表明随着时间的推进，近现代以来育成品种的籼型基因频率逐渐增加。

关键词： 粳型超级稻; 籼型血缘; 遗传组成; 籼粳特异性分子标记

本文引用格式

刘丹# ,王嘉宇# ,孙健,唐亮,陈温福* . 利用InDel和SSILP标记分析北方粳型超级稻的遗传组成[J]. 中国水稻科学, 2014 , 28(2) : 148 -154 . DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2014.02.006

Abstract

Genetic background of 15 superrice and their 21 pedigreerelative varieties (including 12 cultivars released from 1977 to 1999 in northeast and 9 japanese varieties bred from 1963 to 2000) were revealed based on 89 subspecificdifferentiation molecular markers (34 InDel and 55 SSILP). The results showed that indica linage have already introgressed into the genomes of 15 superrice varieties at different level which represented by indicatype frequency (Fi ). The Fi variation of superrice varieties reflected registration periods difference, varieties bred in 2005-2011 were the highest (Fi=0.068), followed by 1977-1999 (Fi=0.033) and rarely in 1963-2000 (Fi=0.011). Consequently, indicaallele frequencies of recent varieties were gradually increased. And this fact demonstrates that a certain proportion of indica linage introducing is an important strategy to the increased yield of northern japonica rice.

Key words： super japonica rice; indica blood relationship; genetic components; subspecificdifferentiation molecular marker

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