<FONT face="Verdana">2个杂交籼稻和2个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及双重PCR技术的初步研究</FONT>

陈树林,王海燕,丁震乾,王秀娥 ,陈忠明,

doi:10.3969/j.issn.1001-7216.2011.01.003

中国水稻科学 >

2011 , Vol. 25 >Issue 1: 19 - 24

DOI: https://doi.org/10.3969/j.issn.1001-7216.2011.01.003

研究报告

2个杂交籼稻和2个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及双重PCR技术的初步研究

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¹南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/细胞遗传研究所，江苏南京210095； ² 江苏明天种业科技有限公司/江苏省农作物种业工程技术研究中心，江苏南京 210014； *通讯联系人， E-mail： hywang@njau.edu.cn; zhongmingchen136@sina.com

收稿日期: 1900-01-01

修回日期: 1900-01-01

网络出版日期: 2011-01-10

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Construction of Molecular Fingerprinting Database and Dual PCR Assay for Two Indica Rice Hybrids and Two Japonica Rice Varieties by Using SSR Markers

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¹State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/Institute of Cytogenetics, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China; ²Jiangsu Mingtian Seeds Science and Technology Co. Ltd/Jiangsu Crop Seeds Engineering Research Center, Nanjing 210014, China; *Corresponding authors, E-mail: hywang@njau.edu.cn; zhongmingchen136@sina.com

Received date: 1900-01-01

Revised date: 1900-01-01

Online published: 2011-01-10

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摘要

用460对水稻SSR引物对5个杂交籼稻及其双亲和16个粳稻品种（系）进行了PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳，筛选出12对稳定性好、多态性高、杂带少的SSR引物作为核心引物，构建了国稻6号和两优培九的SSR指纹图谱。另外，还筛选出9对核心引物，构建了粳稻品种盐稻8号和徐稻4号的分子指纹图谱。其中，筛选出国稻6号的特异性标记5个，两优培九的特异性标记3个，盐稻8号的特异性标记1个，徐稻4号的特异性标记2个。这些特异标记可用于种子纯度的快速鉴定。另外，挑选扩增条带稳定、特异性较好的引物组合，进行了双重PCR分析。

关键词： 杂交水稻; 种子纯度; 种子真实性; 指纹图谱; 双重聚合酶链式反应; 种子鉴定

本文引用格式

陈树林,王海燕,丁震乾,王秀娥 ,陈忠明, . 2个杂交籼稻和2个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及双重PCR技术的初步研究[J]. 中国水稻科学, 2011 , 25(1) : 19 -24 . DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2011.01.003

Abstract

A total of 460 SSR primers were used for amplification of five indica hybrid rice combinations and their parents, and 16 japonica rice varieties (or elite lines). By using the identified codominant specific primers, molecular fingerprinting databases for Guodao 6, Liangyoupeijiu,Yandao 8 and Xudao 4 were constructed. A total of 5, 3, 1 and 2 SSR primers were identified to be specific for Guodao 6, Liangyoupeijiu, Yandao 8 and Xudao 4, respectively. These fingerprints can be used to examine the seed purity of these rice varieties. In addition, to develop dual PCR assay in examination of seed purity and authenticity, SSR primers which could stably amplify clear bands and have good specificity were selected and used in multiplex popymerase chain reaction amplification.

Key words： hybrid rice; seed purity; seed authenticity; fingerprinting; dual polymerase chain reaction assay; seed identification

参考文献

[1]陈忠明, 王秀娥, 赵彦. 两优培九种子纯度的RAPD快速鉴定. 杂交水稻, 2003, 18(4): 55-56.

[2]杨蜀岚, 伏健民, 杨仁崔. 培矮64S为不育系的两系杂交稻杂种纯度的RAPD鉴定. 福建农业大学学报, 1998, 27(1): 6-9.

[3]彭锁堂, 庄杰云, 颜启传. 我国主要杂交水稻组合及其亲本SSR标记和纯度鉴定. 中国水稻科学, 2003, 17(1): 1-5.

[4]李召华, 朱克永, 陈祖武. SSR分子标记技术在杂交水稻种子纯度鉴定中的应用. 杂交水稻, 2006, 21(4): 11-14.

[5]程保山, 万志兵, 洪德林. 35个粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析. 南京农业大学学报, 2007, 30(3): 1-8.

[6]李进波, 方宣钧, 杨国才. 两系杂交稻亲本SSR指纹图谱的建立及其在种子纯度鉴定中的应用. 杂交水稻, 2005, 20(2): 50-53.

[7]张彦, 郭士伟, 何冰. 利用SSR标记建立杂交水稻分子指纹图谱数据库. 江苏农业学报, 2006, 22(2): 181-183.

[8]吴渝生, 杨文鹏, 郑用琏. 3个玉米杂交种和亲本SSR指纹图谱的构建. 作物学报, 2003, 29(4): 496-500.

[9]Chamberlain J S, Gibbs R A, Ranier J E, et al. Deletion screening of the Duchenne muscular dystrophy locus via multiplex DNA amplification. Nucl Acids Res, 1988, 16(23): 1141-1156.

[10]Mullis K, Falcoma F, Scharf S, et al. Specific amplification of DNA in vitro: The polymerase chain reaction. Cold Spring Harbor Symp Quant Biol, 1986, 51: 260.

[11]马雪霞, 王凯, 郭旺珍. 棉花SSR多重PCR技术的初步研究和利用. 分子植物育种, 2007, 5(5): 648-654.

[12] 黄银花, 胡晓湘, 徐慰倬. 影响多重PCR扩增效果的因素. 遗传, 2003, 25(1): 65-68.

[13]彭锁堂, 颜启传. 水稻单粒种子DNA提取及RAPD程序优化研究. 上海交通大学学报, 2002, 20(1): 34-37.

[14]王凤格, 赵久然, 佘花娣. 中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究： Ⅲ.多重PCR技术在玉米SSR引物扩增中的应用. 玉米科学, 2003, 11(4): 3-6.

[15]王凤格, 赵久然, 戴景瑞. 玉米通用SSR核心引物筛选及高通量多重PCR复合扩增体系建立. 科学通报, 2006, 51(23): 2738-2745.

[16]吴明生，贾希海. 多重引物SSR技术鉴定玉米杂交种子纯度的研究. 玉米科学, 2006, 14(5): 38-40.

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